化学構造データ (SMILES記法) を数値データに変換し、データ解析・機械学習で取り扱えるようにします。低分子だけでなく高分子 (単重合体・共重合体) の取扱いが可能です。
低分子もしくは高分子(単重合体)の記述子計算
「データファイル読み込み」にて、CSV形式またはSMI形式の化学構造データ（SMILES記法）をPC内より読み込み表示させます。単重合体の高分子は、モノマー構造 (自由結合手含む) で化学構造データを準備してください。
化学構造データを表示後、構造式の「表示」をクリックすると、各SMILESの構造式が表示されます。※オクテット則を満たしていないなど不自然な構造の分子の場合、エラーメッセージが表示されます。クラウドマシンが休眠状態にあるときは、最初の構造式表示に多少時間を要することがあります。
計算モードで単分子を選択後、分子記述子の種類を選択し、「作成」をクリックすると下部に、記述子計算をして数値変換されたデータセットが表示されます。
※オクテット則を満たしていないなど不自然な構造の分子にて記述子計算を行いますと、RDKitでは-666の数値が入り、その他の分子記述子では処理に失敗します。
必要に応じて、PC内にデータセットを保存します。
サンプルデータセット: